2017年6月24日（土）、第99回全国高等学校野球選手権京都大会の組合せが決まりました。
※（）閉じで括ったカードは1回戦、◎はシード校
【Aブロック】
西乙訓 ― 向陽
（京産大附 ― 大谷）― 北嵯峨
京都八幡 ― 洛北
東山◎ ― 乙訓
【Bブロック】
鴨沂 ― 龍谷大平安◎
（日吉ヶ丘 ― 福知山）― 木津
京都文教 ― （峰山 ― 東稜）
洛星 ― 鳥羽
【Cブロック】
府立工 ― 田辺
（宮津 ― 桃山）― 京都国際◎
舞鶴高専 ― （須知 ― 東舞鶴）
西城陽 ― 朱雀
【Dブロック】
日星 ― 北稜
（桂 ― 網野）― 加悦谷
東宇治 ― 京都共栄◎
堀川 ― 南陽
【Eブロック】
綾部◎ ― 久御山
南丹 ― （京都すばる ― 嵯峨野）
莵道 ― 京都翔英
（京教大附 ― 亀岡）― 紫野
【Fブロック】
大江 ― 海洋
山城◎ ― （京都両洋 ― 西舞鶴）
塔南 ― 京都廣学館
（洛西 ― 京都学園）― 農芸
【Gブロック】
園部 ― 洛東
同志社国際 ― （洛水 ― 同志社）
洛南 ― 京都外大西
（城陽 ― 久美浜）― 京都成章◎
【Hブロック】
立命館◎ ― 福知山成美
立命館宇治 ― （城南菱創 ― 洛陽工・伏見工・京都工学院）
西京 ― 京都明徳
花園 ― 北桑田